Comme on le notait dans la première partie la particularité chez le scalaire est la présence de mutation sur un même locus c'est à dire au même endroit sur le chromosome. Il y a relativement peu de mutations si on le compare au guppy par exemple, mais en plus certaines ne peuvent pas se combiner, car elles sont présentes sur le même locus .
| Locus* | Nom de la mutation |
| 2 | Smockey |
| 3 | Stripless, Zebra |
| 4 | Dark, Marble, gold, Gold marble |
| 5 | Half Black |
| 6 | Pearl |
Donc on ne peut pas avoir des poissons homozygotes pour stripless et Zebra en même temps, on ne peut avoir que (SZ) ou (SS) ou (ZZ). La même chose est vraie pour le locus 4 et c'est quatre mutations.
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